研究院共有三个研发团队，分别为高校研发团队、科研院研发团队、企业研发团队。研究院的最高学术管理机构是专家委员会。专家委员会由从事煤化工、石油化工、能源工程、生物化工、工业催化、氢能源等领域的1名工程院院士、十几名博士生导师和一批专家教授组成。研究院目前主要依托中国石油大学(华东)、天津大学、北京科技大学、北京化工大学、中国科学院成都有机化学有限公司、中石化广州工程公司，作为研究开发新能源、清洁能源技术以及工程化技术的技术平台，共享国家科研和人力资源，走产学研相结合之路。

      十几年来，研究院坚持“立足国内、节约为先、煤为基础、多元发展”，致力于可替代、可再生新能源、清洁能源、绿色能源的研究开发与工程化产业化。研究开发、应用技术领域主要包括低比例M15车用甲醇汽油、高比例M85车用甲醇汽油、甲醇制汽油MTG、甲醇制烯烃MTO、甲醇制芳烃MTA、甲醇制聚甲氧基二甲醚高十六烷值柴油调和组分(DMMn)等。其中，DMMn技术目前处于建设年产5～20万吨的工业示范装置和推广应用阶段。

      近年来，研究院重点研发氢能技术，已经取得了重大突破，结出了丰硕成果。为此，研究院联合产、学、研、设等方面，建立了氢能科研团队，从四个方面加大了研发与应用力度：

      固态金属合金储氢技术。已建立专利体系，TiFe系、TiMn系固态金属合金，可应用于公交车、叉车、电动自行车、大型储能、分布式发电等。

      有机液相储氢运氢供氢技术。已建立专利体系，完成小试并具备中试条件，可应用于工业副产氢的安全储氢运氢、风光电制绿氢的安全储存和大规模长距离运输，以及集装箱式在线制氢加氢站。

      光纤储氢技术，正在进行专利布局与小试，具有后发优势。

      氨裂解制氢小型化、轻量化、模块化技术。正在实施“船用自热式氨分解制氢装置及模块化应用集成”原理样机及工程样机的开发，已建立专利体系。该项技术的应用场景是三个方面：一是船用，氨分解制氢供氢模块可以搭载低温氢燃料电池、固态氧化物电池SOFC、燃气轮机、氢氨内燃机等;二是氨分解制氢零碳加氢站;三是可将中西部地区丰富的风光电资源转化为绿氨绿电，成为最清洁的绿色新能源。